6月27日，司法省根据官吏惩戒令，对发生佐久间越狱事件的札幌刑务所相关者下达了处分决定。

刑务所所长因监督不力受到申斥处分，监管负责人戒护课课长龟冈梅太郎、两名事发当夜执勤的看守各自接受一个月减薪百分之十的处分。同时，那天夜里虽然不值班但默许佐久间违反监规的两名看守部长给予一个月减薪百分之五的处分。

此后，关于佐久间的消息音信全无，估计他是逃进了深山里。

缺粮的状况变得更加严重，主食配给全国平均延期二十天，北海道竟达到九十天，全国最差。

北海道官署害怕居民陷入饥饿状态，极力要求农户交售粮食，一直分摊到町、村一级，有农户答应交售，但相反也有人无视官署的要求，将粮食流向黑市赚了很多钱。北海道知事担忧那种倾向泛滥，不辞辛劳地在农村地带奔走，恳请各町、村的代表按分摊的数量完成交售任务，可是这样的督励几乎毫无效果。官署为了缓和粮食困境申请紧急进口，但美军军政部始终坚持农户的交售不达到百分之百就不准进口的原则。北海道各地不断发生闹米风潮的游行，知事甚至向农业大臣发出极秘电报，暗示“如果进口粮食还不到货，看情形恐怕会发生暴动”。

札幌刑务所里的犯人粮食也难以保证了。幸好鲱鱼丰收向刑务所送来了鲱鱼干，作为经常中断的蛋白源而储藏起来，但搞到的主食的数量很少，不得已增加了分发菜粥的次数。

接着，因为收监犯人员快速增加，使粮食困境雪上加霜。全国刑务所的犯人平均收监率甚至达到定员的百分之一百六十，这个比例还在继续增长。札幌刑务所的情况也一样，单人牢房关押三名犯人，关押佐久间的特设牢房也已经像杂居牢房一样。冬季如果牢房内关押人数多，靠体温也容易熬过寒冷，但随着气温上升，牢房超员，会使犯人倍感痛苦。狭窄的牢房内闷热难熬，臭气熏蒸。夜里被褥叠被褥，处于如过江之鲫甚至无法翻身的状态。犯人们的眼睛里凝聚着越来越浓的焦虑。

所长在定山溪和手稻分别建造临时监舍，作为减少收监人员的措施把犯人转送过去。让他们采伐国有林的树木分别做成木材和柴火。角山农场的监舍里当然也收押了很多犯人，让他们从事农耕作业。

龟冈得知7月上旬岩国少年刑务所发生了集体逃跑事件。该刑务所建筑陈旧、设备简陋，何况收押着接近定员两倍的少年，随着夏天越来越闷热，不满情绪郁积，终于引发集体暴动，十二名少年破坏监舍逃跑。看守们虽然用装满子弹的手枪进行威吓，在刑务所内外将逃跑的少年全部抓获，但发射子弹十七发，一名少年被击毙，两名重伤。

因为去年夏天也发生过暴动和集体逃跑的事件，所以司法省向全国刑务所所长发出指令，要严加警惕，以防发生事故。

札幌刑务所因为地域关系，夏天凉快，监舍里很少溽暑难熬，但所长为了不让超员关押的犯人们感到压抑，让重刑犯也在狱内参加劳动，努力让他们接触到户外的空气。

岩国少年刑务所的逃跑事件发生以后，全国的刑务所再也没有发生过不幸事故，8月也算是平稳度过了。札幌刑务所的犯人们很顺从地参加了狱内劳动。

随着服刑人员的快速增长，看守的工作量也大幅增加。1946年2月由于行政改革，将七千四百二十九人的编制削减到一千人的编制，但当时四万人的囚犯人数已经达到将近八万人，所以凭定编人数已经不可能掌控监控的态势。因此，四个月前的1947年4月，司法省下达命令，宣布将定编人数增加到九千一百四十一人。但看守凭低廉的薪水无法支撑生活，所以愿意当看守的人很少，招募的新人大多是体格孱羸、意志薄弱的不合格者，仍不能补足定编的人数。

看守人员不足，稍能弥补的就是根据1944年发布的通知，从犯人中挑选特警队员。特警队员的挑选标准，作为原则规定为“初犯者，年龄二十三岁至五十岁，军队出身或有教养、有见识的人，品行端正、健康者，尤其是没有逃跑倾向的，残